集智俱乐部 01月25日
Nat. Rev. Neurosci.综述:结构化信息驱动的有向脑连接模型
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本文深入探讨了如何将大脑的结构连接整合到有向连接模型中,以揭示脑区间的信息传递和因果效应。文章总结了三种主要方法:贝叶斯方法利用结构连接定义先验分布;嵌入式方法将结构连接作为固定参数嵌入模型;机器学习方法则整合结构和功能数据进行分析。这些方法显著提升了研究性能,并能捕捉到结构连接对功能活动的限制作用。尽管如此,当前模型仍面临可靠性、泛化性和生物学可解释性等挑战,未来仍需深入研究。

🧠 结构连接与功能连接:文章首先区分了结构连接(基于神经解剖学)和功能连接(基于神经活动同步性),强调了有向连接模型在揭示脑区间因果效应中的重要性。

💡 三种整合方法:文章详细介绍了将结构连接整合到有向连接模型的三种主要方法,包括贝叶斯方法、嵌入式方法和基于机器学习的方法,并分析了各自的特点和应用。

📈 模型性能提升:研究表明,整合结构连接的模型能够显著提升研究性能,通过结构连接作为正则化因子,限制模型参数的搜索空间,提高了模型的稳定性和可靠性。

🔬 应用与挑战:整合结构和功能信息的模型在跨尺度和跨物种研究中表现出良好的适用性,但在可靠性、泛化性和生物学可解释性方面仍面临挑战,需要进一步研究。

原创 集智编辑部 2025-01-25 18:31 北京

深入探讨了如何将大脑的结构连接整合到描述有向脑连接的模型中


关键词:计算神经科学,大脑结构连接,有向连接模型,因果效应




论文题目:Structurally informed models of directed brain connectivity

论文地址:https://www.nature.com/articles/s41583-024-00881-3

期刊名称:Nature Reviews Neuroscience


大脑如何实现复杂的信息传递与功能协调一直是神经科学的核心问题。近期发表在Nature Reviews Neuroscience上的一篇综述文章,深入探讨了如何将大脑的结构连接(structural connectivity)整合到描述有向脑连接(directed connectivity)的模型中。这种结合不仅深化了对脑区间相互影响的理解,也为神经疾病的诊断和治疗提供了新的思路。


大脑的信息传递本质上是方向性的,源于神经元通过轴突单向传播动作电位的机制。然而,在实际研究中,脑连接模型往往分为两类:

为了更好地揭示脑区间的因果效应,研究者转向有向连接模型,其中包括:


图1. 生成和通用状态空间模型在功能性磁共振成像中的应用。


文章详细总结了将结构连接整合到有向连接模型中的三种主要方法:


1. 贝叶斯方法(Bayesian Approach):通过结构连接定义先验分布,例如连接强度越高,对应的先验概率越大。早期研究(如Stephan等人)在动态因果模型(DCM)中引入结构连接权重,优化模型参数,提高了数据拟合的准确性。


2. 嵌入式方法(Embedded Approach):将结构连接直接作为固定参数嵌入状态空间模型。例如,Fukushima等人的模型假设只有存在直接结构连接的脑区间才可能有有向功能连接。这种方法虽然简单,但可能忽略多跳(multi-hop)连接的重要性。


3. 基于机器学习的方法(Machine-Learning-Based Approach):使用动态贝叶斯网络(DBN)或图卷积神经网络(DCRNN)等技术,同时整合结构和功能数据。例如,Dang等人开发的模型结合了fMRI时间序列和结构连接数据,在分类任务中表现出优异的预测能力。


图2. 基于贝叶斯、嵌入式和机器学习的结构化定向连接模型方法


文章指出,整合结构连接的模型显著提升了研究性能。结构连接作为正则化因子,限制了模型参数的搜索空间,提高了模型的稳定性和可靠性。有向连接模型能够捕捉到结构连接对功能活动的限制作用,揭示了两者之间的深刻联系。例如,研究表明结构连接较强的脑区对功能活动的调控更显著。此外,这些模型在跨尺度和跨物种的研究中也表现出良好的适用性,从小鼠到人类的大脑研究均验证了这一点。


最后,文章也强调了这一领域尚待解决的问题。当前模型的可靠性与泛化性仍有不足,特别是跨数据集和跨物种的验证较少。生物学可解释性也是一大挑战,特别是多跳连接在功能调控中的具体作用仍需深入研究。此外,将这些模型应用于神经疾病的个性化诊断和干预还有很长的路要走。整合结构和功能信息的模型不仅推动了对大脑机制的理解,也为开发更精确的神经疾病诊疗工具提供了重要方向。这种跨学科的研究范式展示了神经科学与计算科学深度融合的巨大潜力。



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