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本文探讨了生命起源中复杂生化系统演化的难题,并提出了“分子拼装假说”作为新的解释框架。该假说认为,复杂系统的组成部分最初是为了其他功能而进化,随后通过偶然的组合形成新的功能,最终演化为复杂的系统。文章强调,蛋白质翻译等复杂系统并非一蹴而就,而是通过多个阶段逐步构建而成。研究者提出了分子拼装的两阶段模型,并列举了实验和化学机制作为支持,为生命起源研究提供了新的思路和方向,鼓励研究者关注“为什么进化”的问题,为未来生命起源研究的合作指明了方向。
🧩分子拼装假说提出,复杂系统的部件最初为其他用途而进化,而非直接为最终功能服务,通过偶然组合形成新功能。
🧬分子拼装的两阶段模型:初始阶段,部件为早期功能进化;组合阶段,部件偶然形成集合体,产生新功能并受自然选择强化。
🔬文章提供了实验证据支持分子拼装:非酶促RNA复制、肽与RNA相互作用、原始核糖体功能,这些都显示分子最初可能具有与现在不同的功能。
🔄分子拼装假说还可应用于其他生命起源问题,如代谢网络的扩展和脂质与RNA的相互作用,为研究早期细胞形成提供了新思路。
关键词:复杂生化系统,生命起源,分子拼装假说,分子进化,蛋白质翻译
论文题目:Intellectual frameworks to understand complex biochemical systems at the origin of life论文地址:https://www.nature.com/articles/s41557-024-01698-4
生命的起源涉及从简单分子到复杂系统的演化过程,例如蛋白质翻译。蛋白质翻译是现代生命体中高度复杂且不可或缺的系统,其复杂性令人难以想象如何从简单的分子基础演化而来。传统的“RNA世界理论”提出,RNA既是遗传信息的载体,也是催化反应的酶,从而解决了DNA和蛋白质“先有鸡还是先有蛋”的悖论。然而,该理论在解释复杂系统的进一步进化方面存在局限性。近期发表在Nature Chemistry的观点文章提出“分子拼装假说”(molecular bricolage),认为复杂系统的部件最初进化为与现代功能无关的其他用途,这些部件通过偶然的关联逐渐形成新的功能,最终演化为高度复杂的系统。首先,研究者提出分子拼装的两阶段模型,将复杂系统的进化分为初始和组合阶段。在初始阶段阶段,各部件为了特定的早期功能而进化,如RNA、蛋白质或简单的分子,但这些功能与系统的最终功能无关。例如,早期tRNA可能仅作为催化的辅助因子,而非信息适配器。在组合阶段阶段,这些部件偶然形成粗糙的集合体,展现出新的功能,这种新功能为生物体提供适应性优势,从而受到自然选择的强化。文章列举了支持分子拼装的多个实验与化学机制,为分子拼装模型提供支持。非酶促RNA复制:氨酰化RNA可能促进RNA的快速复制,尽管这一功能最初与蛋白质翻译无关;肽和RNA的相互作用:简单的原肽可以增加RNA的稳定性或作为催化因子辅助反应;原始核糖体的功能:核糖体可能最初并非用于蛋白质合成,而是作为RNA复制酶发挥作用,随后逐渐被用于蛋白质翻译。文章进一步讨论了分子拼装假说在其他生命起源问题中的应用,例如,实验和计算分析显示,代谢网络可能通过重新利用(co-option)现有路径而扩展;脂质与RNA的相互作用可以增强分子功能,为原始细胞的形成提供支持。分子拼装假说的提出为复杂系统的起源提供了全新的视角。通过将复杂系统分解为易于研究的子模块,该理论为设计实验提供了明确方向。研究者指出,现有研究大多集中于“如何实现”,例如合成核酸或氨基酸的方法,而“为什么进化”的问题同样值得深入探讨。未来,这一框架有望推动化学家和生物学家在生命起源领域的进一步合作,为解答生命起源的深层次问题提供思路。图 1. 现代的蛋白质翻译在所有已知的生命形式中都被保留下来,并且需要由许多相互作用的部分组成的复杂分子机器来实现。
图 4. 编码蛋白质合成所需的元素,被假设最初为不相关的功能而进化。
6. 加入集智,一起复杂!
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