Cnbeta 01月13日
研究最多的细菌仅20种 大多数细菌被忽视
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一项研究揭示,仅10种细菌占据了细菌研究论文的一半,而近四分之三的已命名细菌未有任何专门研究。研究人员分析了包含43409种细菌物种的数据库,发现大肠杆菌的研究论文数量遥遥领先。其余研究主要集中在少数人类病原体上。然而,大部分细菌物种在任何索引论文中都未被提及。这种研究偏见,部分原因是微生物组研究中的大规模测序以及实验室培养的难度。研究表明,许多与人类健康相关的微生物未被充分研究,这需要做出调整才能从微生物组研究中获得更大益处。

🔬研究发现,仅10种细菌就占据了细菌研究论文的半壁江山,而74%的已命名细菌物种在任何索引论文中都未被提及,揭示了细菌研究领域的严重不平衡。

🦠大肠杆菌是研究最多的细菌,相关论文超过31.2万篇,占据总论文的21%,其余研究主要集中在金黄色葡萄球菌、结核分枝杆菌和幽门螺杆菌等人类病原体上。

🧪 实验室培养的难易程度是造成研究偏见的重要原因,大肠杆菌等易于培养的细菌往往成为研究热点,而许多与人类健康相关的微生物由于培养困难而未被充分研究。

🧬 微生物组研究中的大规模测序加剧了已知细菌与被研究细菌之间的差距,许多重要微生物,包括与人类健康密切相关的微生物,未能进入研究最多的前50种细菌名单。

美国密歇根大学安娜堡分校的研究人员在一项发表于预印本服务器bioRxiv上的最新研究中发现,仅10种细菌就占据了细菌研究论文的一半,而近四分之三的已命名细菌未有任何针对它们的专门研究论文。

研究团队查阅了一个包含43409种独特细菌物种的数据库,并统计了在PubMed(美国政府运营的生物医学文献库)中提到每种细菌的论文数量。结果显示,有关大肠杆菌的论文数量遥遥领先,超过31.2万篇,占总论文的21%。其余论文主要集中在一些人类病原体上,例如金黄色葡萄球菌、结核分枝杆菌和幽门螺杆菌。然而,令人惊讶的是,74%的细菌物种在任何索引论文的标题或摘要中都未被提及。

在过去25年中,已知细菌与被研究细菌之间的差距不断扩大,这在一定程度上归因于微生物组研究中微生物的大规模测序。虽然科学家们对这一结论感到失望,但也并不意外。除了一些少数例外,人类健康相关的微生物组中大量重要微生物未能进入研究最多的前50种细菌名单。许多与人类健康密切相关的微生物甚至尚未被命名,更不用说深入研究。

研究团队指出,纠正细菌研究的这种发表偏见并非易事,但如果想要从微生物组研究中获得最大益处,这种调整是必需的。一个主要挑战是实验室中难以培养这些未被充分研究的微生物。大肠杆菌之所以成为研究热点,部分原因是它非常容易生长。事实上,许多被研究最多的微生物都具备这一特性。

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