专项整治行动由水利部统筹，长江水利委员会负责组织协调和监督指导，长江流域各省（自治区、直辖市）县级以上地方各级河长制办公室和水行政主管部门具体实施。专项整治行动以加强河道砂石采运管理单管理使用为主线，围绕长江流域河道砂石开采、运输、过驳、堆存等采运砂环节，依法严厉打击整治违规采运砂石和违规使用采运管理单行为，严格采砂船舶集中停靠管理，严肃查处非法采砂船舶和违规收运无证砂石行为。