组委会 2024-10-16 11:13 江苏
关注公众号，发现CV技术之美
主页 ：https://pumachallenge.com/index.html#/
Grand Challenge 平台：https://puma.grand-challenge.org/
目标
赛道 1 – 具有三个实例类别的全景分割
任务 1：肿瘤、间质、上皮、血管和坏死区域的组织语义分割。
任务 2：三类细胞核检测；肿瘤细胞核，TILs（淋巴细胞和浆细胞），以及其他细胞（组织细胞、黑色素细胞、嗜中性粒细胞、间质细胞、上皮细胞、内皮细胞和凋亡细胞）。
赛道 2 – 具有十个实例类别的全景分割
任务 1：肿瘤、间质、上皮、血管和坏死区域的组织语义分割。
任务 2：所有类别的细胞核检测；肿瘤细胞核、淋巴细胞、浆细胞、组织细胞、黑色素细胞、嗜中性粒细胞、间质细胞、上皮细胞、内皮细胞和凋亡细胞。
数据集
该数据集包括 155 个原发性和 155 个转移性黑色素瘤的 H&E 染色 ROI（感兴趣区域），这些 ROI 是手动选择的，并以 40 倍放大倍率（0.22 µm/像素）进行扫描，分辨率为 1024 × 1024 像素。
对于这些 ROI，提供了组织和细胞核的标注，并提供了以 ROI 为中心的 5120 × 5120 像素的上下文 ROI。这些标注由医学专家创建，并由皮肤病理学家检查和校正。
训练数据集
总共有 103 个原发性黑色素瘤 ROI 和 103 个转移性黑色素瘤 ROI 已经公开发布。该公开数据集中包含 97,429 个细胞核，分布在 103 个原发性黑色素瘤 ROI 和 103 个转移性黑色素瘤 ROI 中。
初步测试集（10 个样本）
在挑战过程中，将提供 5 个原发性和 5 个转移性黑色素瘤 ROI 的初步测试集，用于模型验证。这些 ROI 含有 4,860 个细胞核，并用于比赛初期对模型进行测试。
最终测试集（94 个样本）
剩余的 47 个原发性和 47 个转移性黑色素瘤 ROI 作为独立的最终测试集，保留在 PUMA 挑战中使用。该数据集包含 45,406 个细胞核，并将仅用于最终评估阶段
数据集中细胞核的分布
数据集中组织类别区域的分布
时间线
| 日期 | 阶段 |
|---|---|
| 2024年10月10日 | 挑战赛开始，训练数据开放 |
| 2025年1月15日 | 验证排行榜开放 |
| 2025年1月25日 | 测试阶段排行榜开放 |
| 2025年3月1日 | 测试阶段结束并宣布获胜者 |
| 2025年4月15日 | 发布挑战总结和获胜方案 |
组织机构
本次挑战赛由荷兰乌特勒支大学与埃因霍温理工大学联合举办。
END
欢迎加入「医学影像」交流群?备注：med
